Как перейти на рабочий стол в git bash?

От этого пути, каталога пользователя, перейди в каталог Desktop так cd ./Desktop, а затем уже переходи в нужный каталог, расположенный на рабочем столе.

Можно кликнуть правую кнопку мыши и выбрать Git Bash Here. Находясь в нужной папке или как в вашем случае на рабочем столе.

Проще всего, отталкиваясь от домашнего каталога:

cd ~/Desktop/